国际期刊《Frontiers in Microbiology》（微生物学前沿）日前发表了中国地质调查局广州海洋地质调查局冷泉微生物研究新成果“Active Anaerobic Archaeal Methanotrophs in Recently Emerged Cold Seeps of Northern South China Sea（南海北部新发现冷泉的活跃甲烷厌氧氧化古菌）”。
冷泉生态系统蕴藏着大量的微生物和底栖动物群落，主要发育于富含甲烷流体渗漏的陆坡环境。目前，学界已对冷泉系统中的微生物类群进行了广泛的研究，但其中大多数是基于DNA（16S核糖体脱氧核糖核苷酸）测序手段，而DNA的弊端是无法区分活跃和死亡微生物。由于RNA（16S核糖体核糖核苷酸）较易降解，且对于环境的变化极为敏感，因此RNA测序可用于评估环境中的活性微生物。
本研究利用RNA和DNA相结合的分析方法，对南海北部冷泉3个渗漏点的微生物群落（特别是参与甲烷循环的古菌群落）及网络相关性进行了研究。
该研究主要形成三方面的认识：一是通过DNA和RNA测序方法对比沉积物“总菌”和“活菌”的差异性，为有效识别原位冷泉环境下的活性微生物提供新的思路；二是揭示了冷泉不同发育周期对应的微生物群落结构差异，为深入研究冷泉演化过程提供了重要依据；三是初步探讨了冷泉环境中甲烷代谢菌与共生细菌的网络关系，为研究微生物间的相互作用机制提供了参考。
论文第一作者为广州海洋局张亭亭和肖曦工程师，通讯作者为赵静高级工程师，合作作者为陈松泽、陈宗恒、冯俊熙、梁前勇、Tommy J. Phelps、张传伦。该研究由国家自然科学基金（No. 41806074和No.41730528）、南方海洋科学与工程广东省实验室（广州）重大专项创新团队项目（No. GML2019ZD0307）、中国地质调查局海洋地质调查项目（No. DD20190218）共同资助。 （张亭亭）